Em Evil Within 2, Sebastian retorna ao STEM, agora para resgatar sua filha, Lily. A garota tinha, aparentemente, falecido num incêndio, mas na verdade foi sequestrada pela corporação maléfica Mobius (a Umbrella desse mundo) para ser usada como núcleo de Union, uma cidade fictícia dentro dessa "matrix".
Nunca fica exatamente claro por que Lily é especial, e o fato dela ter sido escolhida e Sebastian ser alguém que já tem experiência com o STEM não passa de uma coincidência, mas isso não importa muito quando as coisas começam a caminhar.